1939年12月31日，在維也納金色大廳舉辦了首屆「新年音樂會」，由克來門斯·克勞斯創辦。 第2屆於1941年1月1日舉行，以後除1945年因戰爭原因停辦一屆外，其餘都是於每年的1月1日定期在金色大廳舉行。1946年，新年音樂會正式命名為「維也納新年音樂會」。
從1955年起，音樂會由博斯科夫斯基指揮，直至1979年。自此年起，音樂會由洛林·馬澤爾指揮，直至1986年。
1987年，卡拉揚成為了維也納新年音樂會的指揮，自此往後，音樂會的指揮每一年都會更換。
1939年沒有加演，資料指出直到1945年才有加演。克萊門斯·克勞斯經常隨機的加演。令人驚奇的是，《藍色多瑙河》華爾茲是在1945年第一次演出的，而且是作為加演。最近幾年經常加演的另一曲目老約翰·史特勞斯的拉德茨基進行曲，是在1946年才開始演出的，也是作為加演。直到1958年這兩支曲目才作為常演項目而不是加演，然後它們就成為了音樂會的必演項目。
在閉幕的時候常有非常情況發生，一次是在1967年，當威利·博斯科夫斯基把藍色多瑙河作為了他音樂會曲目的一部分，另一次是2005年，當洛林·馬澤爾把《藍色多瑙河》華爾茲作為了閉幕曲（省略了《拉德斯基進行曲》）以作為2004年印度洋海嘯殉難者的紀念。
博斯科夫斯基在1936—1979年一直是交響樂隊的首席小提琴手。他從1955年—1979年一直指揮維也納新年音樂會。1980年，洛林·馬澤爾成為了首位非奧地利籍的指揮。馬澤爾連續多年擔任指揮以後，從1987年開始，每年選擇明星指揮成為了一項傳統。指揮人選一般由交響樂隊的成員投票決定。
1987年的新年音樂會上，當《拉德茨基進行曲》響起時，觀眾忍不住開始鼓掌打節拍，卡拉揚轉身指揮觀眾一幕被人們所熟知。但實際上早在博斯科夫斯基時代，在演奏《拉德斯基進行曲》時就有觀眾跟著鼓掌了，網路上85、86年的視頻也顯示，馬澤爾就曾轉身示意讓觀眾起身跟著鼓掌。所以認為這一傳統的開端始於卡拉揚是不對的。
從現在留存的資料來看，博斯科夫斯基、馬澤爾和卡拉揚都曾經進行過致辭，只是並沒有在《藍色多瑙河》前面，而在1989年的新年音樂會上，當《藍色多瑙河》前奏響起時，觀眾的掌聲打斷了藝術家們的演奏。克萊伯面向觀眾，說道：「Die Wiener Philharmoniker und ich wünschen Ihnen：Prosit Neujahr!」（中譯：「維也納愛樂樂團和我敬祝大家：新年快樂！」；前半句由指揮所說，「Prosit Neujahr!」則由指揮及所有樂手一齊說出）。致辭這個傳統就固定了在演奏《藍色多瑙河》前，一直延續到現在。而在某些年，一些指揮則會用中文向觀眾們說道「新年好」（1996年，洛林·馬澤爾；1999年，洛林·馬澤爾；2002年，小澤征爾；2005年，洛林·馬澤爾）特別是2002年的小澤征爾只用了中文一種語言（馬澤爾除了中文外還用其他語言）。
從1955年起，音樂會由博斯科夫斯基指揮，直至1979年。自此年起，音樂會由洛林·馬澤爾指揮，直至1986年。
1987年，卡拉揚成為了維也納新年音樂會的指揮，自此往後，音樂會的指揮每一年都會更換。
1939年沒有加演，資料指出直到1945年才有加演。克萊門斯·克勞斯經常隨機的加演。令人驚奇的是，《藍色多瑙河》華爾茲是在1945年第一次演出的，而且是作為加演。最近幾年經常加演的另一曲目老約翰·史特勞斯的拉德茨基進行曲，是在1946年才開始演出的，也是作為加演。直到1958年這兩支曲目才作為常演項目而不是加演，然後它們就成為了音樂會的必演項目。
在閉幕的時候常有非常情況發生，一次是在1967年，當威利·博斯科夫斯基把藍色多瑙河作為了他音樂會曲目的一部分，另一次是2005年，當洛林·馬澤爾把《藍色多瑙河》華爾茲作為了閉幕曲（省略了《拉德斯基進行曲》）以作為2004年印度洋海嘯殉難者的紀念。
博斯科夫斯基在1936—1979年一直是交響樂隊的首席小提琴手。他從1955年—1979年一直指揮維也納新年音樂會。1980年，洛林·馬澤爾成為了首位非奧地利籍的指揮。馬澤爾連續多年擔任指揮以後，從1987年開始，每年選擇明星指揮成為了一項傳統。指揮人選一般由交響樂隊的成員投票決定。
1987年的新年音樂會上，當《拉德茨基進行曲》響起時，觀眾忍不住開始鼓掌打節拍，卡拉揚轉身指揮觀眾一幕被人們所熟知。但實際上早在博斯科夫斯基時代，在演奏《拉德斯基進行曲》時就有觀眾跟著鼓掌了，網路上85、86年的視頻也顯示，馬澤爾就曾轉身示意讓觀眾起身跟著鼓掌。所以認為這一傳統的開端始於卡拉揚是不對的。
從現在留存的資料來看，博斯科夫斯基、馬澤爾和卡拉揚都曾經進行過致辭，只是並沒有在《藍色多瑙河》前面，而在1989年的新年音樂會上，當《藍色多瑙河》前奏響起時，觀眾的掌聲打斷了藝術家們的演奏。克萊伯面向觀眾，說道：「Die Wiener Philharmoniker und ich wünschen Ihnen：Prosit Neujahr!」（中譯：「維也納愛樂樂團和我敬祝大家：新年快樂！」；前半句由指揮所說，「Prosit Neujahr!」則由指揮及所有樂手一齊說出）。致辭這個傳統就固定了在演奏《藍色多瑙河》前，一直延續到現在。而在某些年，一些指揮則會用中文向觀眾們說道「新年好」（1996年，洛林·馬澤爾；1999年，洛林·馬澤爾；2002年，小澤征爾；2005年，洛林·馬澤爾）特別是2002年的小澤征爾只用了中文一種語言（馬澤爾除了中文外還用其他語言）。